Forretningsmodellen for Energi Invest Fyn A/S knytter først og fremmest til at kommercialisere lovende teknologier og dernæst til aktivt at bidrage til den fynske erhvervsudvikling.   
 
Foruden kapital vil Energi Invest Fyn A/S også tilføre projekter værdi i form af forskningsressourcer fra universiteter eller inddrage øvrige relevante kommercielle samarbejdspartnere.

Investeringsemner vil typisk være udviklingsprojekter hos eksisterende virksomheder, der kan tilføres kapital og forskningsressourcer. Eller opfindelser fra universiteter, der kan tilføres kapital og kommercielle samarbejdspartnere.

Processen vil ofte foregå i 3 faser:

1. Nøje udvælgelse af projekter og patentansøgte teknologier med stort kommercielt potentiale.
2. Investering i projektselskaber, der sammen med virksomheder, investorer og forskningsinstitutioner kommercielt modner teknologierne.
3. Slag af projektselskaber eller udlicensiering af deres teknologier.